Во второй части исследования автор продолжает построение единой концепции фундаментальных энергетических взаимодействий на основе гипотезы об универсальном физическом механизме, действующем на всех уровнях материи. Отказ от догм Теории относительности и Стандартной модели физики элементарных частиц, приведших к тупиковому состоянию теоретической физики, позволяет по-новому посмотреть на наблюдаемые феномены и найти ключ к построению «теории всего», соединить теорию и практику, создать модель с объяснительной и предсказательной силой.

Рассматриваемый автором универсальный механизм распространяется и на живые формы материи. Предыдущие попытки создания теории биофизики исходили из гипотезы о наличии особых законов физики для живой материи. Поиск этих законов идет долго и безуспешно. Возможно, это результат неверной постановки вопроса и задачи. Автор предлагает сменить ракурс и показывает, какие общие закономерности есть во всех формах материи. Предлагаемая им концепция создает мост между физикой и биологией, подготавливая базу для строительства моста между Материей и Сознанием в следующих частях исследования.